此时的尼泊尔正处于廓尔喀人建立的沙阿王朝，也是尼泊尔历史上国力最鼎盛的时期。骁勇善战的廓尔喀人不断对外军事扩张，其领土面积是白南穿越前那个时代尼泊尔国土的三倍大。印度的各土邦根本就不是廓尔喀人的对手，廓尔喀人随着不断胜利，野心也慢慢增大，把主意打到了清国的西藏。
1788年6月份，素尔巴尔达布率廓尔喀兵3000人，先后占领西藏南部边境之聂拉木、济咙宗(今西藏吉隆东南)、宗喀宗(今吉隆)等地，围攻协噶尔宗(今西藏定日)。嘉庆新政对于疆藏地区并没有太大的变革，虽然加强了驻藏大臣的权利，但是藏区事务仍由四个噶布伦进行处理。四个噶布伦在看到廓尔喀势大之后，不欲硬拼，就想交钱了事。可是嘉庆得到消息的时候，就有都察院的消息称前藏噶布伦有意私下与廓尔喀人议和。
嘉庆怎能如此吃亏，立即下令，禁止前藏官员私自与廓尔喀议和，如有违抗，严惩不怠。新构建不久的驻藏新军也集结起来，在聂拉木等地区与廓尔喀人交战，双方规模相差不多，虽然器械上清新军占据一定优势，但廓尔喀人的战力也不是盖的，双方交锋清新军除一开始占据了一点优势之外，但是很难匆忙收复失地。
清军自然不止这么一点兵力，嘉庆一面调集其他驻藏清军和四川、青海清军入前藏参战，一面三令五申不允许跟廓尔喀人议和，甚至还下令将一名主和的官员革职，要求上下勠力同心，务必将廓尔喀打服。
甚至在本心里，嘉庆还有顺带灭掉廓尔喀的打算。他这几年虽然也不算是消息闭塞。但是对于一个边陲小国，嘉庆了解不深，并不知道廓尔喀的强劲之处。另一边。嘉庆这几年了解到了大唐在大清周边屡战屡胜，已经将原本大清的一些藩属国纳入旗下。势力着实不小。甚至之前唐人打下了土地，就像是打发小弟一样，将缅甸的一块土地转让给了大清，这让嘉庆心中既是高兴，又有些不服。大清什么时候轮到让唐人来施舍了，所以嘉庆希望能够用一场对外军事胜利，来证明自己。
嘉庆虽然能力不强，但是还是有些小骄傲的。尤其是他在位的这八年中。国内“一片大好”，他是看不到多少农民手工业者破产被唐人带走移民的，他能看到的只有赋税连年增多，而且八年之内居然几乎没有一处民变，似乎天下安定，歌舞升平。殊不知是新政带来的行政体系，对于地方的控制力更强，而且唐人也布控全国，一有风声立即消弭于无形，才导致了这个局面的出现。
唐人不希望看到什么民变自然是不希望出现任何人口的徒劳伤亡。有人拿去移民最好。
反正这一切让嘉庆觉得自己是一个千古名君，贤明英武，不仅在治政上颇有成就。更是要在武功上获得建树，他当然也不考虑嘉庆新政的根底是唐人设计的套路，而自然地归功成自己的成绩。